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Les probiotiques réduisent les effets secondaires gastro-intestinaux induits par les antibiotiques, cependant, leur effet sur la préservation de la composition microbienne intestinale en réponse aux antibiotiques n'est pas bien compris. Une équipe américano-mexicaine a réalisé une revue systématique de la littérature, dont les résultats viennent d'être publiés dans le Journal of Medical Microbiology (16 novembre 2022). Cette revue a pris en compte les articles, parus entre janvier et décembre 2021, qui ont examiné l'effet des antibiotiques, des probiotiques et des deux combinés sur la composition des bactéries dans l'intestin, évaluée grâce à la technologie de l'ARNr 16S. Sur les 29 études retenues, 11 portaient sur l'effet des antibiotiques, 11 sur celui des probiotiques et 7 sur celui des antibiotiques et des probiotiques.Résultats?Les études sur les antibiotiques ont montré une diminution de la diversité bactérienne dans l'intestin après la prise d'antibiotiques. Certains genres et espèces, dont la bactérie bénéfique Faecalibacterium prausnitzii, étaient moins fréquents après la prise d'antibiotiques. Certaines études ont montré que le microbiome intestinal mettait 8 semaines ou plus à se rétablir.Les résultats des études sur les probiotiques étaient moins clairs: seules 4 sur 11 ont montré une augmentation de la diversité bactérienne dans l'intestin après la prise de probiotiques. Selon les auteurs, cela pourrait être dû au fait que les personnes avaient déjà un microbiome intestinal varié avant de prendre des probiotiques.Dans cinq des sept études qui ont ajouté des probiotiques aux antibiotiques, les patients étaient moins susceptibles de souffrir de diarrhée ou d'autres symptômes gastro-intestinaux. Dans quatre études, l'ajout de probiotiques a contribué à préserver la diversité bactérienne.Les chercheurs reconnaissent qu'il est difficile de tirer des conclusions définitives en raison de la grande diversité des méthodes utilisées dans les essais, notamment en ce qui concerne les types d'antibiotiques, les types de probiotiques et la durée des traitements.Des probiotiques, oui, mais"L'ensemble des données disponibles plaide en faveur de la prescription de probiotiques parallèlement à un traitement antibiotique. Lorsque les participants prennent des antibiotiques, nous observons plusieurs changements cohérents dans certaines espèces bactériennes. Mais lorsque le traitement était associé à des probiotiques, la majorité de ces changements étaient moins prononcés et certains complètement évités. Compte tenu des données disponibles à ce jour, il ne semble pas y avoir de raison de ne pas prescrire de probiotiques lorsque des antibiotiques sont prescrits", commente l'une des auteurs de l'étude, la Pr Elisa Marroquin (Université chrétienne du Texas)."Sur la base de cette revue, je ne pense pas que nous puissions recommander un type spécifique d'intervention probiotique", nuance Laura McCoubrey, doctorante en pharmacie à l'UCL School of Pharmacy, dans The Pharmaceutical Journal du 18 novembre 2022, estimant que l'étude ne fournit pas suffisamment de preuves pour justifier la prescription de probiotiques en même temps que d'antibiotiques. "Je recommanderais plutôt aux patients de s'assurer qu'ils ont suffisamment de sources prébiotiques dans leur alimentation (les fibres des fruits et légumes) pour favoriser le rétablissement d'un microbiome de base sain". Selon elle, la diversité des probiotiques utilisés, et leur durée d'action, rend difficile la formulation d'une recommandation spécifique aux patients: "À moyen ou long terme, je pense que l'avenir passera par des prescriptions personnalisées de probiotiques. Si les microbiomes individuels des patients sont séquencés, cela permettrait aux prescripteurs d'identifier les espèces microbiennes spécifiques dont un patient pourrait manquer".